Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr5Q04683 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr5Q04683 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms