Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CkbQ04447 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CkbQ04447 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CkbQ04447 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CkbQ04447 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CkbQ04447 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms