Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp11Q02853 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp11Q02853 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp11Q02853 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms