Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pax5Q02650 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms