Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga4Q00651 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga4Q00651 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms