Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcf7Q00417 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcf7Q00417 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms