Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc1P98083 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shc1P98083 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc1P98083 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shc1P98083 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms