Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc2P97363 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc2P97363 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc2P97363 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms