Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim43cP86449 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43cP86449 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms