Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
H3f3aP84244 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3f3aP84244 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3f3aP84244 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms