Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiitaP79621 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiitaP79621 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CiitaP79621 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiitaP79621 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiitaP79621 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CiitaP79621 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CiitaP79621 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiitaP79621 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms