Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stra8P70278 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stra8P70278 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stra8P70278 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms