Protein–RNA interactions for Protein: P70174

Hrh1, Histamine H1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh1P70174 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hrh1P70174 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hrh1P70174 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hrh1P70174 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms