Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkacbP68181 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkacbP68181 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms