Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp2P63044 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp2P63044 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms