Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrx1P63013 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx1P63013 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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