Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Polr2lP62876 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr2lP62876 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms