Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23aP62751 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms