Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppp1cbP62141 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ppp1cbP62141 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ppp1cbP62141 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms