Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmo4P61969 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms