Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm2P58774 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms