Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpdl3bP58242 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpdl3bP58242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms