Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gsc2P56916 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms