Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TdgP56581 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TdgP56581 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TdgP56581 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TdgP56581 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TdgP56581 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TdgP56581 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdgP56581 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdgP56581 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdgP56581 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdgP56581 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TdgP56581 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TdgP56581 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TdgP56581 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TdgP56581 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdgP56581 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdgP56581 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TdgP56581 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdgP56581 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdgP56581 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TdgP56581 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TdgP56581 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TdgP56581 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TdgP56581 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TdgP56581 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TdgP56581 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms