Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defb1P56386 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defb1P56386 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
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