Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp1P55194 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1P55194 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1P55194 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms