Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PolgP54099 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PolgP54099 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolgP54099 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PolgP54099 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolgP54099 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PolgP54099 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PolgP54099 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolgP54099 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolgP54099 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolgP54099 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolgP54099 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolgP54099 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolgP54099 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolgP54099 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolgP54099 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolgP54099 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolgP54099 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolgP54099 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolgP54099 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolgP54099 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms