Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApodP51910 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ApodP51910 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ApodP51910 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ApodP51910 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ApodP51910 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ApodP51910 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ApodP51910 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ApodP51910 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ApodP51910 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApodP51910 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApodP51910 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApodP51910 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApodP51910 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApodP51910 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApodP51910 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApodP51910 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms