Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc1a1P51906 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc1a1P51906 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a1P51906 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms