Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clcn3P51791 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcn3P51791 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn3P51791 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn3P51791 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms