Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccr5P51682 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr5P51682 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms