Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl9P51410 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl9P51410 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl9P51410 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms