Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd7P50283 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd7P50283 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd7P50283 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms