Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Brcc3P46737 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brcc3P46737 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms