Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc2P46471 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc2P46471 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms