Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f2P43135 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2f2P43135 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f2P43135 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms