Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept1P42209 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept1P42209 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept1P42209 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sept1P42209 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept1P42209 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept1P42209 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept1P42209 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms