Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc19a1P41438 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc19a1P41438 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc19a1P41438 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms