Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik2P39087 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik2P39087 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik2P39087 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik2P39087 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms