Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd22P35329 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd22P35329 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd22P35329 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms