Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoc1P34928 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc1P34928 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms