Protein–RNA interactions for Protein: P33173

Kif1a, Kinesin-like protein KIF1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1aP33173 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kif1aP33173 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kif1aP33173 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif1aP33173 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif1aP33173 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms