Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mep1aP28825 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mep1aP28825 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms