Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms