Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myo5bP21271 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myo5bP21271 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms