Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc1P19123 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnc1P19123 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc1P19123 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms