Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18529 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18529 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18529 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18529 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18529 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18529 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18529 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18529 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18529 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P18529 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18529 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18529 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18529 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18529 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18529 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18529 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18529 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18529 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P18529 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18529 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18529 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P18529 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18529 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18529 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18529 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18529 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18529 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18529 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18529 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18529 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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