Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CnpP16330 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CnpP16330 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CnpP16330 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CnpP16330 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CnpP16330 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CnpP16330 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CnpP16330 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CnpP16330 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CnpP16330 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CnpP16330 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CnpP16330 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CnpP16330 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CnpP16330 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CnpP16330 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CnpP16330 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CnpP16330 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CnpP16330 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CnpP16330 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CnpP16330 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CnpP16330 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CnpP16330 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CnpP16330 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CnpP16330 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CnpP16330 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CnpP16330 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CnpP16330 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CnpP16330 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CnpP16330 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CnpP16330 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CnpP16330 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnpP16330 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CnpP16330 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CnpP16330 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CnpP16330 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CnpP16330 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CnpP16330 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnpP16330 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CnpP16330 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CnpP16330 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CnpP16330 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CnpP16330 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CnpP16330 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CnpP16330 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CnpP16330 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CnpP16330 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms