Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkceP16054 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkceP16054 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkceP16054 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkceP16054 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkceP16054 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms