Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp53P15975 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp53P15975 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp53P15975 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp53P15975 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp53P15975 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp53P15975 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp53P15975 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms